Il est important de tenir compte du contexte clinique lors de l’interprétation des résultats des tests d’amplification des acides nucléiques multipathogènes, car ces analyses détectent l’ADN et non nécessairement des organismes viables.
La présence de Salmonella spp, Shigella spp, Campylobacter spp et Yersinia enterocolitica dans une culture de selles est, à première vue, pathologique.
Cependant, il existe des porteurs sains de Salmonella spp, et toutes les salmonelloses ne doivent pas nécessairement conduire à la prescription d’antibiotiques.
En outre, Yersinia enterocolitica n’est pas toujours pathogène, et l’antibiothérapie contre la yersiniose doit être limitée aux personnes symptomatiques ou à celles qui risquent de contracter des infections sanguines.
La présence d’Escherichia coli, même en grande quantité, ne doit pas être considérée comme pathologique. Seules les E. coli productrices de shiga-toxines (STEC) doivent être considérées comme pathogènes. Les E. coli entéropathogènes ne provoquent des diarrhées aiguës que chez les enfants.
En l’absence de signes de gravité (choc septique ou sepsis « récent »), pas de carbapénème, même en présence d’un facteur de risque d’ESBL.
Si le facteur de risque (cf. ci-dessous) et la gravité (septicémie, choc septique) sont présents, envisager :
- ajouter l’amikacine à l’antibiothérapie empirique (ou la gentamicine si elle n’est pas disponible).
- La prescription d’imipénem ou de méropénem ne doit être réservée qu’aux cas les plus graves et/ou à la documentation relative à l’ESBL au cours des 3 derniers mois, jusqu’à l’obtention d’une documentation bactériologique.
Autres facteurs de risque
- Utilisation récente d’amoxicilline/clavulanate, de céphalosporines de deuxième ou troisième génération (C2G, C3G) ou de fluoroquinolones au cours des 3 derniers mois.
- Infection associée aux soins de santé.
- Colonisation ou infection par des entérobactéries productrices de BLSE au cours des 3 derniers mois.
- Voyages effectués au cours des 3 derniers mois dans des régions à haut risque (par exemple, l’Inde, l’Asie du Sud-Est, le Moyen-Orient, l’Afrique du Nord, le bassin méditerranéen).
